我校自1995年开始，先后与武汉大学、华中科技大学、华中师范大学等重点高校联合培养硕士研究生，目前已有17年联合培养研究生教育经历。2011年经教育部批准为开展培养硕士专业学位研究生试点工作单位，2012年开始独立招生;2024年学校获批硕士学位授予单位，新增药学、教育、电子信息三个硕士专业学位授权点。2011年以前研究生教育管理工作归口科研处。研究生处于2011年11月正式成立，负责研究生管理和学科建设等方面的工作。

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